איראן הגיבה באיומים לתקיפה האמריקנית על מתקני הגרעין שלה, כאשר שר החוץ האיראני, עבאס עראקצ‘י, הזהיר הבוקר (ראשון) מפני "השלכות ארוכות טווח" של המתקפה. עראקצ'י הדגיש כי איראן שומרת לעצמה את הזכות להגן על "ריבונותה, האינטרסים שלה ועמה". 

משלחת איראן לאו"ם פנתה בבקשה דחופה לכנס את מועצת הביטחון כדי "לשמור על השלום הבינלאומי ולגנות את התקיפות האמריקניות". נשיא ארצות הברית, דונלד טראמפ, איים בתגובה עוצמתית יותר במידה וטהרן תחליט להגיב למתקפה. 

למרות האיומים החריפים, נראה כי טהרן מנסה להמעיט מחומרת התקיפה ולשדר יציבות. גורם איראני בכיר אמר לסוכנות רויטרס: "טרם התקיפה, הועבר כל האורניום המועשר מהמתקן בפורדו למקום אחר". הגורם הוסיף כי מספר העובדים באתר צומצם למינימום לפני המתקפה.

חבר ועדת הביטחון הלאומי בפרלמנט האיראני, איסמאעיל כות'רי, אמר כי "ננקטו הצעדים הנחוצים כדי לשמור על המתקנים הגרעיניים. נמשיך בהתקפות על ישראל, ובסיסים אמריקניים באזור לא יהיו בטוחים בשום צורה. התקיפה שלהם תהיה קלה הרבה יותר מאשר על ישראל".

מנאן ראיסי, חבר פרלמנט מהמחוז שבו ממוקם אתר פורדו, ניסה להרגיע את הציבור בטענה כי הנזק אינו משמעותי. "בהתבסס על מידע מדויק, אני יכול לקבוע כי בניגוד לטענותיו של נשיא ארצות הברית השקרן - מתקן הגרעין בפורדו לא ניזוק קשות ורוב הנזק נגרם רק על הקרקע, אותו ניתן לשקם. אני יכול לומר בביטחון שכל דבר שיכול היה להוות סכנה לאנשים כבר פונה, ולא דווח על קרינה גרעינית. אפילו לא דווח על הרוג אחד באתר זה". הוא סיים באיום: "עכשיו איראן היא זו שקובעת כיצד ובאיזה אופן להגיב לטיפשות האמריקנית הברורה הזו".

משמרות המהפכה האיראניים ניסו גם הם למזער את הנזק ושיגרו איום לעבר ארצות הברית: ״מספרם, פיזורם וגודלם של בסיסי הצבא האמריקנים באזור החריפו את חולשתו. הטכנולוגיה הגרעינית המקומית של איראן לא תושמד על ידי אף מתקפה״. 

הרשויות האיראניות טענו כי לא נרשמו סימנים לזיהום רדיואקטיבי בעקבות התקיפות, והוסיפו כי אין סכנה לתושבים המתגוררים בסמוך לאתרים שהותקפו. כתב סוכנות הידיעות האיראנית תסנים טען כי "החיים מתנהלים כרגיל" באזור פורדו.