שאלה חשובה על א"י מהגמרא

כתוב בתחילת פרק רביעי בקידושין שא"י גבוהה מכל הארצות ובית המקדש גבוה מכל ארץ ישראל. והיה לי קשה. קודם כל ידוע שיש מקומות יותר גבוהים מא"י. ועוד, ים המלח ידוע כמקום הנמוך ביותר בעולם וכי יש בארץ ישראל את ההר הגבוה בעולם כדי שיתיישב שבא"י יש גם את המקום הכי גבוה וגם את המקום הכי נמוך כנראה שאי אפשר לתרץ שהכוונה ל"גובה" -מבחינה רוחנית או מבחינת חשיבות כיוון שהתוס` בסנהדרין דף פז. מקשה שעין העיטם גבוה מביהמ"ק ומתרץ שכותלי בהמ"ק גבוהים יותר וגובהם ק` אמה. בקיצור רואים שמדובר מבחינה גאוגרפית ולא רוחנית או חשיבותית. ברצוני להעיר שייתכן שטעותי נובעת מכך שאני מבין שגובה זה המרחק של הדבר ממרכז כדור הארץ. בקיצור, אשמח אם תוכלו להסביר לי כיצד המדע תופש את המילה גובה בענין זה ולמה הגמ` התכוונה...